杭州师范大学医学部前身是1979年创办的浙江医科大学杭州分校(护理教育办学历史可追溯至1917年)。学部下设6个学院:基础医学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、临床医学院、口腔医学院,拥有1家直属三甲附属医院、13家非直属附属医院、80多家教学实践基地,“治未病”、“抗衰老”、“中西医结合抗肿瘤”、“植物状态和意识科学研究”等领域的研究处在国际第一方阵。
医学部具有博士生、硕士生招生资格。拥有“治未病与健康管理”服务国家特殊需求博士人才培养项目,护理学、公共卫生与预防医学等一级学科硕士学位点,临床医学、口腔医学、药学、护理等专业硕士学位类别。拥有临床医学、预防医学、口腔医学、护理学、公共事业管理(卫生事业管理方向)、健康服务与管理、药学等7个本科专业。学部与10多个国家的多所院校建立了校际友好合作与交流关系,每年选派优秀学生赴国内外知名高校开展交流学习,学部还承担10多个国家的留学生教育。