福建中医药大学原名福建中医学院,创建于1958年,是中国创办较早的高等中医药院校之一,2003年成为福建省重点建设高校8所之一,2010年3月经教育部批准更名为福建中医药大学。学校占地面积近1200亩,其中旗山校区占地面积935亩,屏山校区占地面积161亩。
截至2013年10月,学校有教职员工2700多人,在校生近1万人;设有13个学院,两个研究院。学校与美国、德国、澳大利亚、日本、马来西亚、台湾、香港等国家和地区的高等院校、科研医疗机构、学术团体建立了稳定的合作关系。
学校的发展目标是把学校建设成为一所以中医药为主体,多学科协调发展,服务海峡西岸经济区,具有鲜明办学特色的教学研究型中医药大学。